化学组装如何向生命体中的催组装学习

发布日期:2024-01-25     浏览次数:次   

近日,yl6809永利官网催组装研究团队在Chemical Society Review上发表了以“What can molecular assembly learn from catalysed assembly in living organisms?”为题的综述文章,系统总结了生命体如何利用催组装方法构筑复杂组装体系,阐述了化学组装应如何向生命体学习催组装这一高效、高选择性的策略。

田中群教授2012年首次在国际上提出了可控组装新方法——催组装。催组装(catassembly)是通过加入一类称为催组剂”(catassembler)的物质,加速组装过程,或者协助组装基元选择合适的组装路径而获得目标组装体;催组剂在组装前后不发生变化,也不存在于最后的组装体中。究其功能而言,催组剂之于分子组装,正如催化剂之于化学反应,且越复杂的组装越需要催组装的帮助。

生命体中的许多组装过程需要其他分子的帮助和调控。例如,蛋白质的折叠需要分子伴侣的协助,核小体的组装需要组蛋白伴侣的帮助和调控,蛋白酶体的组装需要多达10催组剂的参与。本文利用分级分类的方法梳理了生命催组装现象及机理,阐明了催组剂如何广泛参与到蛋白质折叠、染色质组装、蛋白质复合物的组装等重要生命过程。系统介绍了催组剂介导的解组装、组装基元替换、组装状态改变和维持等重要过程。文章指出催组装是生命体面对复杂的组装环境、组装过程所发展出的高效、高选择性方法。

本文进而从组装基元设计、组装方法发展、表征和理论方法三个方面提出了人工催组装体系的研究思路。文章提出了三种可能的催组装模型,重点分析了催组剂活化组装基元、促进组装的机制,提出了四种可能的催组剂离去方式。同时,按照催组剂加速组装过程、协助选择组装路径、修复错误组装三种类别综述了部分人工催组装体系及其功能应用。

最后,本文从系统科学和复杂性科学的角度对催组装进行了讨论。依据多则异的理论,多组分参与的复杂组装体系更有可能涌现新的强大功能。催组剂在复杂组装体系中可以扮演建筑工搬运工调度员信号兵医生等多种角色,对组装体系的良好运转是不可或缺的。此外,文章概述了催组装和催化的异同;以及人工智能科学应用于催组装乃至分子组装研究的重要潜力。

本文在田中群教授带领下,由雷志超博士、杨柳林副教授、王忻昌副教授、瞿航博士、曹晓宇教授等共同撰写,通讯联系人为田中群教授和杨柳林副教授。生命科学家生化与细胞所吴家睿研究员、生物物理所李国红研究员、李伟研究员也参与了讨论和撰写,化学界同仁上海交大樊春海教授,北京大学张文彬教授、孙轶斌博士,微纳院杨扬教授等提供了有益的观点和讨论。文章题献给不幸离世的中科大梁好均教授,向其表达敬意。本工作主要由国家自然科学基金委催组装研究方法和理论基础重大项目(21991130219911312199113321991134)资助完成。

文章链接:https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/cs/d3cs00634d



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